《企业所得税法实施条例》第三十五条规定，企业缴纳的补充养老保险费、补充医疗保险费，在国务院财政、税务主管部门规定的标准和范围内，准予扣除。补充养老保险即企业年金，是我国养老保险制度改革体系中的重要组成部分，它与基本养老以及个人的商业养老保险共同构成养老保障的三大支柱。作为养老保险的补充，企业年金由企业方和员工方共同缴费构成。基本养老是强制性的，任何企业都必须执行，且允许税前扣除。而企业年金却是企业自愿的，有条件的企业可以建立年金制度。《财政部、国家税务总局关于补充养老保险费补充医疗保险费有关企业所得税政策问题的通知》（财税[2009]27号）规定：“自2008年1月1日起，企业根据国家有关规定，为在本企业任职或者受雇的全体员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，分别在不超过职工工资总额5%标准内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除，超过的部分不予扣除”。

　　但在财税[2009]27号文件中，并未明确职工工资总额是按当年计算还是按照上年度计算。《企业年金试行办法》第八条规定，企业缴费每年不超过本企业上年度职工工资的十二分之一，企业和职工个人缴费合计一般不超过本企业上年度职工工资总额的六分之一。另外，由于企业年金采取的是自愿的原则，并不一定涉及所有职工。因此，企业所得税只能根据已纳入企业年金范围的职工的工资总额这个基数计算扣除。例如，某企业有员工200人，2010年度工资总额为960万元。那么，该企业如果为全体员工缴纳年金的话，缴纳额应不超过960×1÷12=80（万元），允许税前扣除的企业年金为960×5%=48（万元），企业缴纳了80万元的年金，则有80-48=32（万元）不得税前扣除。如果按照自愿的原则，该企业只有150人缴纳企业年金，150人的工资总额为720万元，缴纳额应不超过720×1÷12=60（万元），允许税前扣除的企业年金为720×5%=36（万元），企业缴纳了60万元的年金，则有60-36=24（万元）不得税前扣除。

　　关于企业年金的税前扣除问题，还应根据《财政部关于企业新旧财务制度衔接有关问题的通知》（财企[2008]34号）规定执行，即“补充养老保险的企业缴费总额在工资总额4%以内的部分，从成本（费用）中列支。企业缴费总额超出规定比例的部分，不得由企业负担，企业应当从职工个人工资中扣缴。个人缴费全部由个人负担，企业不得提供任何形式的资助。《企业财务通则》施行以前提取的应付福利费有结余的，符合规定的企业缴费应当先从应付福利费中列支。”这样，一方面，企业所得税允许工资总额5%标准内的部分准予扣除，另一方面，对超过工资总额4%的部分不能在成本（费用）中列支。这又应当如何进行企业所得税处理呢？其实，财企[2008]34号文件的规定是针对国有企业而言的，是为了防止国有资产流失，所以在行文范围上明确为“党中央有关部门，国务院各部委、各直属机构，总后勤部、武警总部，有关人民团体，各省、自治区、直辖市、计划单列市财政厅（局），新疆生产建设兵团财务局，各中央管理企业”，并不适用非国有企业。另外，虽然对国有企业超过工资总额4%的部分不能在成本（费用）中列支，但在年度企业所得税申报时，对于企业年金不超过上年度职工工资总额5%标准内的部分仍可以在税前扣除，对超过1%的部分应当当作调减应纳税所得额处理。

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